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论著 | 更新时间:2015-06-30
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生物信息学方法筛选乳腺癌关键基因初探

广西医学 2013第35卷01期 页码:22-24

作者机构:广西医科大学研究生学院; 广西医科大学附属肿瘤医院

基金信息:【基金】 广西医疗卫生科研课题(重2010079)

DOI:10.11675/j.issn.0253-4304.2013.01.07

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目的 寻找具有诊断或靶向治疗作用的乳腺癌关键基因。方法 通过美国国立生物技术信息中心(NCBI)中已明确的乳腺癌相关数据集,运用生物信息学中的基因组富集分析(GSEA)初步筛选,并富集出相应的通路;在此基础上继续用Meta分析方法筛选出乳腺癌的关键基因。结果 根据GSEA和Meta分析出差异基因22个,再与NCBI数据中与乳腺癌相关的基因的结构、功能比较,得出TGFBR2、CDKN1A、GADD45α、CXCL12为关键基因。结论 TGFBR2、CDKN1A、GADD45α、CXCL12等基因与乳腺癌细胞周期、分化和凋亡有密切关系,可进一步研究以期作为乳腺癌诊断和靶向治疗的基因。

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