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专家共识 | 更新时间:2017-09-27
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骨髓增生异常综合征患者骨髓微小RNA-340-3p的表达情况及生物信息学分析

广西医学 2017第39卷09期 页码:1285-1287+1308

作者机构:广西医科大学第一附属医院血液科

基金信息:【基金】国家自然科学基金(81560028;81160072);广西自然科学基金(2010GXNSFB013064)

DOI:10.11675/j.issn.0253-4304.2017.09.01

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目的 探讨微小RNA(miR)-340-3p在骨髓增生异常综合征(MDS)患者骨髓中的表达情况,并应用生物信息学技术分析其靶基因及功能。方法 利用基因表达谱芯片结合分层聚类在9例MDS患者和6例健康正常人骨髓中筛选出差异表达的miR-340-3p,并利用miRBase和Miranda软件预测其靶基因,并对预测的靶基因进行功能富集和信号通路分析。结果 与健康正常人比较,miR-340-3p在MDS患者骨髓中表达下调(P<0.05)。获得共同76个潜在靶基因,包括BANP、KIF2C、DIDO1、GRM1等。基因本体(GO)分析显示靶基因主要富集于细胞生物学、分子功能、细胞组分,信号通路分析显示其主要富集于FoxO信号通路、NOD样受体信号通路、造血细胞系、Gap连接等信号转导通路等。结论 miR-340-3p在MDS患者骨髓中表达下调,其可能通过靶向负向调控下游的靶基因而参与MDS的发生发展。

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