目的 了解崇左市各级医疗机构传染病防控措施落实现状，比较2012与2015年各项防控措施实施情况，有针对性指导各级医疗机构落实好传染病防控各项工作。方法 实地调查组织管理制度完善及宣传培训、疫情报告、医院感染监测、医疗废物处置、预检分诊点、感染性疾病科门诊等情况，并填写《医疗机构传染病预防控措施现场调查表》。结果 (1) 与2012年相比，2015年综合医院与乡镇卫生院组织管理制度完善和开展宣传培训占比均提高（100%比70.00%，91.86%比66.28%；100%比85.00%，91.86%比45.35%，均P＜0.05）。（2）与2012年相比，2015年乡镇卫生院建立门诊日志登记与村卫生室建立传染病登记占比均有提高（100%比74.42%，87.07%比67.83%，均P＜0.05）。（3）与2012年相比，2015年综合医院环境卫生学监测开展率提高，乡镇卫生院则降低（100%比75.00%，48.84%比59.30%，均P＜0.05）。（4）与2012年相比，2015年综合医院和乡镇卫生院实行分类收集和使用专用包装物及容器占比均提高（100%比65.00%，83.72%比54.65%；100%比75.00%，80.23%比68.60%，均P＜0.05）。综合医院和乡镇卫生院建立交接登记记录占比均提高,但村卫生室占比降低（100%比65.00%，86.05%比43.02%，9.01%比17.66%，均P＜0.05）。乡镇卫生院个人防护符合要求占比提高,而村卫生室占比降低（100%比84.88%，18.20%比28.32%，均P＜0.05）。（5）按要求设置预检分诊点占比，综合医院2012和2015年均为100%，而乡镇卫生院2015年高于2012年（83.72%比68.60%，P＜0.05）。（6）2015综合医院染性疾病科门诊要求设置、流程布局合理、具有消毒隔离条件并执行占比均较2012年明显提高（均P＜0.05）。20所综合医院均配备有必要的防护用品。结论 综合医院防控工作逐渐走上规范化轨道；乡镇卫生院、村卫生室传染病防控工作整体还处于较薄弱状态，需要加强传染病各项措施落实情况的督导和技术培训，以降低传染病传播的风险。