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论著·基础研究 | 更新时间:2016-06-23
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缺血性脑卒中患者外周血miRNA生物信息学分析研究

广西医学 2016第38卷06期 页码:759-761+765

作者机构:广西医科大学附属民族医院神经内二科

基金信息:【基金】国家自然科学基金(81360191);广西医药卫生科研课题(Z2015105)

DOI:10.11675/j.issn.0253-4304.2016.06.02

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目的 应用生物信息学技术分析缺血性脑卒中患者外周血中微小RNA(miRNA)的靶基因及其功能、在疾病中的作用。方法 在GEO数据库中检索缺血性脑卒中基因芯片数据,并利用生物信息学工具筛选差异表达的miRNA,对差异表达的miRNA进行靶基因预测分析,对miRNA靶基因进行生物学功能分析及信号通路分析,最后构建miRNA调控网络和miRNA靶基因调控网络。结果 检索到芯片数据GSE55937,筛选得到50个差异表达的miRNA。筛选出的miRNA的靶基因的合集共7 557个。这些靶基因的功能主要为DNA依赖转录、DNA依赖转录调节等,主要分布在丝裂原活化蛋白激酶信号通路、肿瘤信号通路等信号通路。miRNA功能的调控分析及miRNA靶基因调控网络图提示,人类miRNA(hsa-miR)-15a-5p、hsa-miR-106b-5p、hsa-let-7c-5p、hsa-let-7i-5p、hsa-let-7g-5p中心度最高。结论 缺血性脑卒中患者外周血中存在差异性表达的miRNA,hsa-miR-15a-5p、hsa-miR-106b-5p、hsa-let-7c-5p、hsa-let-7i-5p、hsa-let-7g-5p与缺血性脑卒中的发病密切相关。

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