目的 比较深圳市及南宁市儿童流行性乙型脑炎(乙脑)的临床特征及差异。方法 收集2009年深圳市及南宁市147例乙脑患儿的临床资料,对其进行临床特征比较分析。结果 2009年深圳市乙脑疫情比南宁市严重,表现为发病例数增加,起病急、发展快、病情重,并发心肌损害比率高;而且乙脑特异性IgM抗体检查阳性率较南宁市显著降低。结论 不同地区流行性乙脑的临床特征不尽相同,可能与传染源、致病病毒株、传播媒介等相关因素有关。