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论著.生物信息技术 | 更新时间:2024-08-27
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基于生物信息学分析DNM3OS在胶质母细胞瘤中的表达情况及其临床意义
DNM3OS expression in glioblastoma and its clinical significance based on bioinformatics:an anlytic study

广西医学 页码:1067-1073

作者机构:宁理懂,硕士,主治医师,研究方向为神经胶母细胞瘤。

基金信息:崇左市科技计划项目(崇科FA2020024)

DOI:10.11675/j.issn.0253-4304.2024.07.18

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目的 基于生物信息学分析动力蛋白3反链/反义RNA(DNM3OS)在胶质母细胞瘤(GBM)中的表达情况及其临床意义。方法 (1)利用肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库及中国脑胶质瘤基因图谱数据库分析DNM3OS在GBM中的表达水平,根据TCGA数据库获取的资料分析DNM3OS与GBM患者临床特征的关系,采用COX回归模型分析DNM3OS表达水平与GBM患者总生存期的关系;利用 LinkedOmics数据库获取DNM3OS与GBM的共表达基因,采用Pearson相关性分析DNM3OS与共表达基因表达情况的相关性;利用Immunity文章提供的24种免疫细胞的markers分析DNM3OS与免疫细胞的相关性。(2)获取GBM及脑出血患者的临床标本,采用实时荧光定量PCR分析两组患者DNM3OS表达水平。结果 (1)TCGA数据库信息显示,DNM3OS在多种肿瘤中存在差异表达,其在GBM组织中呈高表达,DNM3OS表达与GBM患者的异柠檬酸脱氢酶(IDH)突变状态及性别有关(P<0.05)。生存分析结果显示,与低表达组相比,高表达组的GBM患者总生存期更短(P<0.05)。Pearson相关分析结果显示,与DNM3OS相关性最强的前20个基因与DNM3OS表达水平呈正相关(P<0.05)。免疫细胞浸润与DNM3OS表达的相关性分析结果提示,DNM3OS表达水平与多种免疫细胞浸润丰度相关(P<0.05)。(2)临床数据结果显示,DNM3OS在GBM脑组织中的表达水平低于脑出血患者脑组织(P<0.05)。结论 在TCGA数据库获取的关于GBM资料中,DNM3OS呈高表达,其表达水平与GBM患者的IDH突变状态及性别有关,DNM3OS高表达者预后不良,DNM3OS与多种免疫细胞浸润丰度相关。但DNM3OS在GBM中的表达水平仍需进一步研究探索。

目的 基于生物信息学分析动力蛋白3反链/反义RNA(DNM3OS)在胶质母细胞瘤(GBM)中的表达情况及其临床意义。方法 (1)利用肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库及中国脑胶质瘤基因图谱数据库分析DNM3OS在GBM中的表达水平,根据TCGA数据库获取的资料分析DNM3OS与GBM患者临床特征的关系,采用COX回归模型分析DNM3OS表达水平与GBM患者总生存期的关系;利用 LinkedOmics数据库获取DNM3OS与GBM的共表达基因,采用Pearson相关性分析DNM3OS与共表达基因表达情况的相关性;利用Immunity文章提供的24种免疫细胞的markers分析DNM3OS与免疫细胞的相关性。(2)获取GBM及脑出血患者的临床标本,采用实时荧光定量PCR分析两组患者DNM3OS表达水平。结果 (1)TCGA数据库信息显示,DNM3OS在多种肿瘤中存在差异表达,其在GBM组织中呈高表达,DNM3OS表达与GBM患者的异柠檬酸脱氢酶(IDH)突变状态及性别有关(P<0.05)。生存分析结果显示,与低表达组相比,高表达组的GBM患者总生存期更短(P<0.05)。Pearson相关分析结果显示,与DNM3OS相关性最强的前20个基因与DNM3OS表达水平呈正相关(P<0.05)。免疫细胞浸润与DNM3OS表达的相关性分析结果提示,DNM3OS表达水平与多种免疫细胞浸润丰度相关(P<0.05)。(2)临床数据结果显示,DNM3OS在GBM脑组织中的表达水平低于脑出血患者脑组织(P<0.05)。结论 在TCGA数据库获取的关于GBM资料中,DNM3OS呈高表达,其表达水平与GBM患者的IDH突变状态及性别有关,DNM3OS高表达者预后不良,DNM3OS与多种免疫细胞浸润丰度相关。但DNM3OS在GBM中的表达水平仍需进一步研究探索。

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