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论著·基础研究 | 更新时间:2015-03-26
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基于生物信息学方法筛选卵巢癌铂类化疗耐药相关基因的研究

广西医学 2014第36卷12期 页码:1692-1694

作者机构:广西医科大学第一附属医院妇科; 广西壮族自治区妇幼保健院;

DOI:10.11675/j.issn.0253-4304.2014.12.04

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目的 从分子水平揭示卵巢癌化疗耐药的发病机制,为进一步的临床研究提供参考。方法 在公共基因芯片数据库GEO中找到卵巢癌相关基因芯片数据,使用Bioconductor R 2.13.0软件包对其进行分析,找到卵巢癌化疗铂类化疗耐药相关基因;利用STRING 9.1、DAVID 6.7在线工具对这些基因进行生物学分析。结果 共获得283个差异表达基因,其中表达上调基因69个,下调表达基因214个。62个基因的蛋白有相互关系,确定ESR1、IGF1、SDC2、ADCY2、ADCY8、PTHLH、BMP等为关键基因。这些基因的功能主要涉及底物特异性通道活性、被动的跨膜转运活性,参与钙信号通路、MAPK信号通路等。结论 利用生物信息学的方法分析基因芯片数据可有效筛选并确定其中的关键基因,卵巢癌铂类化疗耐药的发生与基因分子水平表达变化有关,确定复发性卵巢癌相关基因的功能及其参与通路为研究卵巢癌耐药的治疗靶点提供了新的思路。

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