目的 比较低频重复经颅磁刺激（rTMS）和失眠认知行为疗法（CBT-I）治疗儿童失眠症的临床效果和安全性。方法 将68例失眠症患儿随机分为研究组1(n=17)、研究组2(n=18)、研究组3(n=17)和对照组(n=16)。给予研究组1、研究组2、研究组3低频rTMS治疗8周（刺激数目分别为1 000次、1 200次、1 400次），给予对照组CBT-I治疗8周。于治疗前及治疗第8周末，对4组患儿进行多导睡眠监测，并采用匹兹堡睡眠质量指数（PSQI）及儿童睡眠习惯问卷（CSHQ）评估其睡眠质量总体情况和睡眠习惯。记录4组患儿在治疗过程中不良反应的发生情况。结果 （1）治疗第8周末，4组患儿的实际睡眠总时间、睡眠潜伏期、觉醒时间、觉醒次数、睡眠效率及快速眼动睡眠潜伏期均较治疗前改善（均P＜0.05）；研究组3患儿的实际睡眠总时间较研究组1及对照组增加，觉醒次数和快速眼动睡眠潜伏期均较其他3组减少或缩短（均P＜0.05）。（2）治疗第8周末，4组患儿的非快速眼动睡眠1期、快速眼动睡眠期均较治疗前改善，研究组2和研究组3患儿的非快速眼动睡眠3期均较治疗前改善（均P＜0.05）；研究组3患儿的非快速眼动睡眠1期较对照组缩短，非快速眼动睡眠3期较其他3组延长，快速眼动睡眠期较研究组1及对照组延长（均P＜0.05）。（3）治疗第8周末，4组患儿的PSQI总分和CSHQ总分均较治疗前降低，且3个研究组患儿的PSQI总分及研究组3患儿的CSHQ总分均较对照组降低(均P＜0.05)。（4）4组患儿不良反应发生率差异无统计学意义（P＞0.05）。结论 低频rTMS可以缩短失眠症患儿的入睡时间，减少其觉醒次数，改善其睡眠质量和睡眠习惯，效果优于CBT-I，且不良反应少，患儿接受度高，值得临床应用推广。