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论著.生物信息技术 | 更新时间:2023-05-29
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基于生物信息学方法分析B3GNT7基因在甲状腺癌组织中的表达水平及其对免疫细胞浸润的影响

广西医学 2023第45卷07期 页码:804-810

作者机构:西安交通大学第二附属医院普通外科

基金信息:【基金】陕西省自然科学基础研究计划(2020JM-404)

DOI:10.11675/j.issn.0253-4304.2023.07.13

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目的 基于生物信息学方法分析β-1,3-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶7(B3GNT7)基因在甲状腺癌组织中的表达水平及其对免疫细胞浸润的影响。方法 在肿瘤免疫评估资源数据库、GEPIA2数据库、UALCAN数据库中检索B3GNT7基因在甲状腺癌患者癌组织和癌旁组织中的表达情况,分析不同临床特征、病理分期甲状腺癌患者癌组织中B3GNT7基因的表达水平,采用多因素COX回归模型分析B3GNT7基因表达水平与甲状腺癌患者预后的关系,采用Spearman相关性模型分析B3GNT7基因表达水平与甲状腺癌组织中免疫细胞浸润丰度的相关性,以及B3GNT7基因表达水平与免疫细胞标志物、T淋巴细胞标志物、免疫检查点基因表达水平的相关性。结果 B3GNT7基因在甲状腺癌患者癌组织中的表达高于癌旁组织(P<0.05)。不同病理分期的甲状腺癌患者癌组织中的B3GNT7基因表达水平具有差异性(P<0.05)。多因素COX分析结果显示,CD8+T淋巴细胞、B3GNT7基因表达水平是甲状腺癌患者预后的影响因素(均P<0.05)。Spearman相关性分析结果显示,B3GNT7基因表达水平与B淋巴细胞、CD4+T淋巴细胞、CD8+T淋巴细胞、巨噬细胞、树突状细胞、中性粒细胞的浸润丰度,以及细胞毒性T淋巴细胞相关蛋白4(CTLA4)的表达水平密切相关(均P<0.05),还与多种免疫标志物的表达水平相关。结论 B3GNT7基因在甲状腺癌组织中呈高表达,其表达水平与甲状腺癌患者的病理分期密切相关,B3GNT7基因与甲状腺癌组织中B淋巴细胞、CD4+T淋巴细胞、CD8+T淋巴细胞、巨噬细胞、树突状细胞、中性粒细胞的浸润丰度相关,且与CTLA4表达密切相关。

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