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论著.生物信息技术 | 更新时间:2023-01-30
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基于网络药理学探讨荔枝核“异病同治”胃癌和肝癌的作用机制

广西医学 2022第44卷23期 页码:2764-2770

作者机构:广西中医药大学研究生院; 广西中医药大学附属瑞康医院消化内科

基金信息:【基金】国家自然科学基金(81360531);广西自然科学基金(2020GXNSFAA238030);广西中医药大学研究生教育创新计划项目(YCSZ2022018)

DOI:10.11675/j.issn.0253-4304.2022.23.12

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目的制基于网络药理学探索荔枝核“异病同治”胃癌和肝癌的作用机制。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台搜索荔枝核的有效化学成分及其作用靶点,利用GeneCards数据库、OMIM数据库获得胃癌和肝癌相关靶点,将胃癌和肝癌相关靶点和荔枝核有效化学成分的作用靶点取交集后得到共同靶点。借助STRING平台和CytoScape 3.7.2软件构建共同靶点的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并筛选核心靶点。采用Metascape平台对荔枝核治疗胃癌和肝癌的共同靶点进行基因本体论(GO) 功能富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果 筛选得到荔枝核有效化学成分8个,对应作用靶点179个,胃癌相关靶点1 177个,肝癌相关靶点1 281 个。荔枝核治疗胃癌、肝癌的共同靶点有61个,进一步筛选得到核心靶点20个,包括MYC原癌基因、雌激素受体1、细胞周期蛋白D1、表皮生长因子受体等。GO功能富集分析结果显示,荔枝核治疗胃癌和肝癌涉及的生物过程主要有凋亡信号通路、对无机物质的反应等;涉及的细胞组分主要有膜筏、囊泡腔等;涉及的分子功能主要有激酶结合、DNA结合转录因子结合等。KEGG 通路富集分析结果显示,荔枝核治疗胃癌和肝癌主要与癌症相关通路、血管内皮生长因子(VEGF)信号通路、缺氧诱导因子1(HIF-1)信号通路有关。结论 荔枝核主要通过调节凋亡信号通路等生物过程,作用于膜筏、囊泡腔等细胞组分,进而实现激酶结合、DNA结合转录因子结合等分子功能,以及调控癌症相关通路、VEGF信号通路、HIF-1信号通路等,最终起到防治胃癌和肝癌的作用。

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