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论著.生物信息技术 | 更新时间:2022-11-07
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基于网络药理学的荔枝核抗肝纤维化作用机制研究

广西医学 2022第44卷18期 页码:2142-2147

作者机构:广西中医药大学研究生院; 广西中医药大学瑞康临床医学院

基金信息:【基金】国家自然科学基金(81660779);广西研究生教育创新计划资助项目(YCSY2020053)

DOI:10.11675/j.issn.0253-4304.2022.18.16

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目的 运用网络药理学探讨荔枝核抗肝纤维化的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台检索荔枝核的有效活性成分,采用 Perl 软件对荔枝核有效成分的作用靶点进行预测。通过GeneCards和OMIM数据库获取肝纤维化相关靶点,将其与荔枝核有效成分的作用靶点取交集,得到荔枝核-肝纤维化靶点。利用CytoScape软件构建“中药-活性成分-基因靶点-疾病”网络。针对荔枝核-肝纤维化靶点,构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络并筛选核心基因,同时进行功能富集分析和通路富集分析。结果 (1)筛选得到8个荔枝核有效活性成分、87个有效活性成分的作用靶点、6 899个肝纤维化相关靶点,通过取交集得到79个荔枝核-肝纤维化靶点。(2)“中药-活性成分-基因靶点-疾病”网络提示荔枝核主要通过6种有效活性成分(甘露醇、β-谷甾醇、谷甾醇、豆甾醇、表儿茶素、槲皮素)作用于荔枝核-肝纤维化靶点发挥作用。(3)PPI网络共筛选出的30个核心基因。(4)荔枝核-肝纤维化靶点共参与101个生物学过程,涉及74条信号通路。结论 荔枝核可能通过甘露醇、β-谷甾醇、谷甾醇、豆甾醇、表儿茶素、槲皮素等有效活性成分,干预多靶点并调节多条信号通路,从而达到抗肝纤维化的效果。

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