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论著.生物信息技术 | 更新时间:2022-08-05
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基于网络药理学探讨参麦注射液治疗新型冠状病毒肺炎的作用机制

广西医学 2022第44卷12期 页码:1384-1391

作者机构:广西中医药大学药学院; 广西中医药大学赛恩斯新医药学院; 广西中医药大学第一附属医院药学部

基金信息:【基金】广西自然科学基金(2017GXNSFAA198171);广西中青年教师基础能力提升项目(KY2016YB830)

DOI:10.11675/j.issn.0253-4304.2022.12.15

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目的 基于网络药理学探讨参麦注射液治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的作用机制。方法 通过检索中药系统药物学数据库及分析平台、BATMAN-TCM数据库及查阅文献,获取参麦注射液的活性成分;利用上述两个数据库及Swiss Target Prediction数据库预测活性成分相关靶点。通过CTD数据库检索COVID-19相关靶点后,利用在线平台Venny2.1.0将其与活性成分相关靶点取交集,筛选出参麦注射液治疗COVID-19的作用靶点。采用Cytoscape 3.7.2软件构建活性成分-作用靶点网络,并进行网络拓扑学分析。针对参麦注射液治疗COVID-19的作用靶点,采用Cytoscape 3.7.2软件构建蛋白-蛋白互相作用(PPI)网络并进行网络分析,采用DAVID数据库进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并通过KEGG数据库获取作用靶点-通路网络。结果 共筛选得到参麦注射液的活性成分112个及其相关靶点807个,COVID-19相关基因472个,取交集后得到148个共同作用靶点(即参麦注射液治疗COVID-19的作用靶点),对应94个活性成分。参麦注射液治疗COVID-19的主要活性成分属于人参皂苷、麦冬皂苷、植物甾醇等;活性成分-作用靶点网络显示,PTGS2、STAT3、FGF1、HSP90AA1、IL-2、BCL2等靶点的度值较高。PPI网络分析结果显示MAPK1、MAPK3、AKT1、JUN、TP53、RELA、TNF、IL-6、JAK、CASP8、EGFR等靶点可能是参麦注射液治疗COVID-19的核心靶点。参麦注射液治疗COVID-19的作用靶点主要涉及与调控细胞凋亡和分解代谢等相关的生物过程,以及与病毒和细菌感染、肿瘤、炎症等相关的信号通路,其中PI3K/AKT、TNF、HIF-1等为最重要的信号通路。结论 参麦注射液的活性成分可能主要是通过作用于PTGS2、AKT1、JUN、TP53、RELA、EGFR等靶点,调控PI3K/AKT、TNF、HIF-1等信号通路来抑制新型冠状病毒和机体的炎症反应、调节细胞凋亡和机体免疫功能,从而达到治疗COVID-19的目的。

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