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论著.生物信息技术 | 更新时间:2022-06-30
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基于网络药理学方法探讨当归芍药散治疗帕金森病的作用机制

广西医学 2022第44卷09期 页码:1003-1012

作者机构:陕西省商洛市商南县医院神经内科;陕西中医药大学第一临床医学系中西医结合临床; 陕西省西安市中医医院脑病科

基金信息:【基金】陕西省中医药管理局中医药科研课题(ZYPT009)

DOI:10.11675/j.issn.0253-4304.2022.09.16

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目的 基于网络药理学方法探讨当归芍药散治疗帕金森病的作用机制。方法 (1)利用中药系统药理学数据库与分析平台筛选当归芍药散的主要活性成分及其对应的靶点,通过GeneCards数据库、MalaCards数据库、DisGeNET数据库、Therapeutic Target Database 数据库、OMIM数据库、UniProt数据库筛选帕金森病相关的靶点。将当归芍药散活性成分靶点与帕金森病靶点取交集后,使用STRING 11.0数据库构建共同靶点的蛋白质-蛋白质互相作用(PPI)网络,利用Cytoscape软件筛选关键蛋白。采用DAVID 6.8数据库针对共同靶点进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。(2)将SH-SY5Y细胞分为对照组、当归芍药散组、1-甲基-4-苯基-吡啶离子(MPP+)组、当归芍药散+MPP+组,分别给予健康小鼠血清、当归芍药散含药血清、MPP、当归芍药散含药血清+MPP+干预,检测ɑ-突触核蛋白(ɑ-Syn)、活化型Caspase3、活化型Caspase9、Parkin、PTEN诱导假定激酶1(PINK1)的蛋白表达水平。结果 (1)共获得当归芍药散化合物83个、靶点基因141个,帕金森病相关的靶点8 192个,取交集后获得111个共同靶点。PPI网络后共获得关键蛋白19个,主要包括白细胞介素(IL)6、血管内皮生长因子A(VEGFA)、肿瘤坏死因子(TNF)、过氧化氢酶(CAT)、前列腺素内过氧化物合酶2(PGGS2)等。GO功能富集分析结果显示,共同靶点涉及的细胞组分包括细胞核、细胞连接、突触后膜等,主要正向调控RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录、血管生成、细胞分裂、蛋白质寡聚化等生物学过程,负向调控蛋白结合、钙离子转运、平滑肌细胞增殖、双细胞紧密连接组件等调控的生物学过程,并调控胆碱能突触传递、DNA模板转录、腺苷酸环化酶抑制G蛋白偶联乙酰胆碱受体信号通路等调控的生物学过程。KEGG通路富集分析结果显示,共同靶点可以通过肿瘤坏死因子信号通路、钙信号通路、缺氧诱导因子1信号通路、Toll样受体信号通路等多条信号通路发挥作用。(2)与对照组相比,MPP+组的PINK1和Parkin蛋白表达水平下降,α-Syn、活化型Caspase9、活化型Caspase3蛋白表达水平上升(均P<0.05);与MPP+组相比,当归芍药散+MPP+组的PINK1和Parkin蛋白表达水平上升,α-Syn、活化型Caspase9、活化型Caspase3蛋白表达水平下降(均P<0.05)。结论 当归芍药散可通过作用于白细胞介素6、血管内皮生长因子A、肿瘤坏死因子、过氧化氢酶、前列腺素内过氧化物合酶2等多靶点,来调节肿瘤坏死因子信号通路、钙信号通路、缺氧诱导因子1信号通路、Toll样受体信号通路等,从而发挥治疗帕金森病的作用,但其具体作用机制有待于进一步研究证实。

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