目的 探讨分级诊疗背景下农村乡镇卫生院运行过程中存在的问题，进而提出“强基层”的对策和建议。方法 采用典型调查方法，抽取安徽省某市3个县区（A区、B县、C县）全部乡镇卫生院，收集其相关卫生计生部门2014～2017年的统计数据，对比分析各县区乡镇卫生院的运行情况。结果 财政对该市乡镇卫生院财政补助总额年均增长率约为12.42%；A区乡镇卫生院诊疗人次总体上呈波浪式上升趋势；B、C两县出院人数总体上呈波浪式下降；A区、B县和C县工作总量年均增长速度分别为7.21%、2.32%和10.45%；2019年该市乡镇卫生院卫技人员占全部医疗机构卫技人员的比重、床位占比较2014年减少。结论 财政经费的保障使乡镇卫生院财务运营压力得到缓解，但基层医疗卫生资源配置结构问题依旧存在，乡镇卫生院的服务能力亟待提高。建议完善绩效分配制度、医保报销制度，鼓励基层医务人员开展基本医疗服务，以促进分级诊疗的实施。