近年来肠道菌群和神经系统疾病的关系备受关注，肠道和中枢神经之间存在双向通信系统即"肠-脑轴"，沿着"肠-脑轴"目前可以确定的是肠道菌群至少可通过迷走神经、免疫系统、神经内分泌系统等途径参与脑功能的生理和病理进程，但如何动态调节肠道菌群的组成及代谢功能，进而维持正常脑神经功能甚至防治脑神经退行性疾病仍面临巨大挑战。中医药能促进肠道菌群的自我恢复，维持肠道正常微生态平衡，这为动态调节肠道菌群提供了重要的操作手段。本文就肠道菌群影响脑神经功能途径的研究进展及中医药在这一领域研究现状做一综述，以深入了解肠道菌群影响脑神经功能机制，拓展对脑活动调控机制的认识，探索中医药对肠道菌群调节的作用机制及途径，为防治脑神经系统疾病提供新思路。