目的 筛选肺鳞状细胞癌（LUSC）中受甲基化调控的基因，并分析其临床意义。方法 从癌症和肿瘤基因图谱数据库中，下载338例LUSC组织和38例正常肺组织mRNA测序数据及DNA甲基化数据。采用R语言软件处理mRNA表达数据，筛选出差异表达基因(DEG)，再运用受试者工作特征(ROC)曲线评估DEG鉴别LUSC组织和正常肺组织的效能，筛选出候选基因。使用minfi软件包分析TCGA数据库中甲基化数据，筛选出差异甲基化位点。利用MEXPRESS数据可视化工具，分析候选基因表达与其启动子区域DNA甲基化位点之间的相关性，筛选出与甲基化相关的目的基因及其位点。应用实时荧光定量PCR，检测21例LUSC患者癌组织及相应癌旁正常肺组织中目的基因的表达水平。结果 筛选出目的基因SOX15及其cg01029592与cg13159929两位点。338例LUSC患者组织中SOX15 mRNA相对表达量高于38例正常肺组织中的表达量（log2FC=4.758，P＜0.001）。ROC曲线分析结果显示，SOX15高表达对鉴别LUSC组织和正常肺组织具有较高效能（曲线下面积为0.910，P＜0.001）。位点cg01029592、cg13159929在LUSC组织中甲基化水平均低于正常肺组织（P＜0.05）。在LUSC组织中SOX15的表达与cg01029592及cg13159929位点的甲基化水平呈负相关（均P＜0.05）。位点cg01029592、cg12615880高甲基化水平者的总体生存率均高于低甲基化水平者(P＜0.05)。实时荧光定量PCR结果显示，LUSC组织的SOX15 mRNA的相对表达量高于癌旁正常组织(P＜0.05)。结论 SOX15或可成为LUSC肿瘤特异性标志物。SOX15启动子区低甲基化可能导致其mRNA高表达，并且与LUSC预后相关。