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论著·基础研究 | 更新时间:2019-04-09
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乳腺癌中靶向抑制REST协阻抑制因子3表达的微小RNA的预测及其高通量数据验证

广西医学 2019第41卷05期 页码:579-581+609

作者机构:江苏医药职业学院基础医学部;江苏医药职业学院护理学院

基金信息:【基金】江苏医药职业学院科技创新团队建设计划(20188104);江苏省“青蓝工程”项目(2016)

DOI:10.11675/j.issn.0253-4304.2019.05.12

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目的 预测并采用高通量数据验证乳腺癌中靶向抑制REST协阻抑制因子3(RCOR3)基因表达的微小RNA(miRNA)。方法 分别利用RNA22、miRanda、PicTar、TargetScan和PITA 5种不同软件预测靶向抑制RCOR3基因表达的miRNA,然后取其交集。通过高通量数据验证所获miRNA对RCOR3表达的负向调控作用,并经泛癌症分析进一步验证miRNA对RCOR3表达的抑制作用。结果 取交集后得到miRNA-128-3p、miRNA-27a、miRNA-27b和miRNA-19b-3p。乳腺癌中miRNA-128-3p、miRNA-27a、miRNA-27b及miRNA-19b-3p与RCOR3基因表达水平均呈负相关(P<0.05)。泛癌症分析结果显示,结直肠腺癌、肺腺癌、肾透明细胞癌和子宫内膜癌中miRNA-128-3p与RCOR3基因表达均呈负相关(均P<0.05),结直肠腺癌、膀胱尿路上皮癌、肺腺癌、肺鳞癌、肾透明细胞癌、子宫内膜癌和急性髓性白血病中miRNA-27a与RCOR3基因的表达均呈负相关(均P<0.05)。结论 乳腺癌中miRNA-128-3p和miRNA-27a、miRNA-27b及miRNA-19b-3p具有潜在的靶向抑制RCOR3表达的功能。

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