肠道菌群可调节宿主的营养吸收、能量代谢、免疫等生理过程，是人体的重要“器官”。研究发现，肠道菌群丰度呈昼夜节律震荡，且肠道菌群昼夜节律（肠道生物钟）失调可导致肠道菌群及代谢物质变化，对宿主的代谢功能产生深远影响。本文对肠道菌群及肠道生物钟对宿主代谢的作用机制及影响因素进行综述。